按制曲原材料来分主要是有小麦和稻米。故各自称为麦曲和米曲。用稻米制的曲，类型也许多，如用米粉制成的小曲，用蒸熟的米饭制成的红曲或乌衣红曲，米曲（米曲霉）。
按原材料是否熟化处理可分成生麦曲和熟麦曲。
按曲的形体可分成大曲（草包曲，砖曲，挂曲）和小曲（饼曲），散曲。
按酒曲中微生物的来源，分成传统酒曲（微生物的天然接种）和纯种酒曲（如米曲霉接种的米曲，根霉菌接种的根霉曲，黑曲霉接种的酒曲）。
现代大致将酒曲分成五大类，各自用以不同的酒。它们是：
麦曲，主要是用以黄酒的酿造；
小曲，主要是用以黄酒和小曲白酒的酿造；
红曲，主要是用以红曲酒的酿造（红曲酒是黄酒的一个品种）；
大曲，用以蒸馏酒的酿造。
麸曲，这是现代才发展起来的，用纯种霉菌接种以麸皮为原材料的培养物。可用以代替部分大曲或小曲。迄今麸曲法白酒是中国白酒生产的主要是操作法之一。其白酒产量占总产量的70%以上。
